Lactancia, Bifidobacterium y resistencia antimicrobiana: cómo se forma el "resistoma" intestinal del lactante

Un estudio publicado en Nature Communications analizó 265 metagenomas fecales longitudinales de 66 díadas madre-bebé para investigar cómo la lactancia y la colonización temprana por Bifidobacterium moldean el resistoma intestinal del lactante —es decir, el conjunto de genes de resistencia a antibióticos (ARGs) presentes en su microbiota— durante el primer año de vida.

A diferencia de estudios previos centrados únicamente en la composición microbiana, este análisis siguió la dinámica del resistoma mismo, usando secuenciación metagenómica profunda en cuatro momentos: 7 días, 1, 6 y 12 meses de vida. Sus hallazgos principales se resumen en los siguientes puntos:

La carga total de genes de resistencia antimicrobiana en el intestino del lactante disminuyó de forma significativa durante el primer año de vida. A los 7 días fue mayor que la de las madres; a los 6 y 12 meses, ya era menor que la materna.

Bifidobacterium resultó ser el género bacteriano determinante: los lactantes con alta abundancia de Bifidobacterium (>70%) presentaron una carga de resistoma significativamente menor que los de baja abundancia (<30%), de forma consistente en los cuatro puntos de tiempo evaluados. Este efecto fue independiente del modo de parto o del tipo de lactancia.

La lactancia materna exclusiva durante el primer mes de vida aceleró la reducción de genes de resistencia y garantizó una menor carga de resistoma a los 6 meses. La suspensión temprana de la lactancia (antes de los 6 meses recomendados por la OMS) se asoció con un enriquecimiento significativo de múltiples genes de resistencia.

El hallazgo más relevante desde la perspectiva clínica: la lactancia materna exclusiva logró revertir el impacto negativo de la cesárea sobre el resistoma. Los recién nacidos por cesárea mostraron mayor carga de resistencia a los 7 días que los nacidos por parto vaginal, pero esa diferencia se anuló cuando el lactante fue amamantado de forma exclusiva durante el primer mes de vida. Los autores señalan que este es el primer estudio en identificar la lactancia exclusiva como estrategia capaz de contrarrestar los efectos del parto por cesárea sobre el resistoma.

Los géneros bacterianos que más portaban genes de resistencia en etapas tempranas fueron Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus y Klebsiella, típicamente asociados a colonización hospitalaria. La baja abundancia de Bifidobacterium se asoció, en cambio, con mayor colonización por E. coli y E. faecium, portadores de una proporción más alta de genes de resistencia.

El mecanismo propuesto: la dominancia de Bifidobacterium en el intestino del lactante está ligada al consumo de oligosacáridos de la leche humana (HMO), que favorecen selectivamente su crecimiento. Los autores plantean que Bifidobacterium podría suprimir directamente a los taxones portadores de resistencia, aunque señalan que algunas especies del propio género portan resistencia a tetraciclinas, un matiz que evita una lectura simplista de "más Bifidobacterium, cero resistencia".

Entre las limitaciones reconocidas: la muestra es de 66 díadas, relativamente pequeña para un estudio metagenómico; los autores no desarrollaron software propio de análisis, y advierten que estudios previos en otras poblaciones (cohorte de Bangladesh) muestran que la protección asociada a Bifidobacterium pierde fuerza después de los 2 años de edad, cuando la microbiota evoluciona hacia un perfil más adulto.

Los autores concluyen que la lactancia materna exclusiva constituye una intervención natural, escalable y de bajo costo para mitigar la diseminación de resistencia antimicrobiana en la primera infancia, complementando sus beneficios de salud ya establecidos, y recomiendan que las políticas públicas de apoyo a la lactancia consideren este efecto adicional sobre la resistencia a antibióticos.

Breastfeeding and early Bifidobacterium-driven microbial colonization shape the infant gut resistome Samarra A. y col. Nature Communications (2025) 16:6099

https://drive.google.com/file/d/1sZAwNnMjPgXKVdWnC52jdi3rV4wJSJ5D/view?usp=sharing